Причина в том, что разработчики phpVirtualBox съехали с платформы google.code, изменившей политику так, что их не устроило, на sourceforge. Сам jandegr тоже собрался съезжать.
Хорошая новость в том, что версия VirtualBox поднята до 4.2.16. Однако переезд - половина пожара, текущая версия инсталлера одного дня от роду, лежит на дропбоксе и пр. прелести. Так что я пока остерегусь обновляться и вам не советую. Острые углы пообтешут - тогда и вернёмся к вопросу. Тем же, кто ставит впервые - см как устанавливать в упомянутой ветке в форуме.