Чтобы это дело исправить надо создать файл /usr/local/www/owncloud/.user.ini и записать в него новые параметры. Например - 512 Мб
1) входим в джейл, даём команду
nano /usr/local/www/owncloud/.user.ini
и заносим в файл строки
upload_max_filesize = "512M"
post_max_size = "512M"
Сохраняем
2) Заодно добавим в наш джейл чтение текущих настроек
даём команду
echo '

Знаки на картинке придётся набрать, ЖЖ не позвоялет такое иметь в тексте.
3) в браузере набираем https://192.168.1.55:81/phpinfo.php
и поиском по слову size смотрим параметры upload_max_filesize и post_max_size
4) Чтобы они изменились на заданные, надо либо перезапустить lighttpd либо просто остановить и вновь запустить джейл owncloud
5) Повторяем п 3, видим, что параметры изменились
6) Если подключиться к owncloud и подвести курсор к иконке загрузки, можно увидеть новый предельный размер загружаемых файлов

Источник - пост alexey123 на форуме nas4free